La chiesa di San Francesco, opera dell'architetto Fra'Bevignate, risale alla seconda metà del XIII secolo ed è divisa in tre navate separate da colonne ottagonali.
All'interno della chiesa sono da segnalare gli affreschi della cappella sul lato sinistro, attribuiti a Ottaviano Nelli.
Oggi il complesso della chiesa e convento di San Francesco è sede della Raccolta d'Arte del Convento di San Francesco.